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Grégory OPERTO
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THÈSE
Sujet de thèse :
Analyse surfacique de données fonctionnelles cérébrales |
Directeur(s) de thèse :
Rémy Bulot et Olivier Coulon |
Date de début de thèse :
Octobre 2005 |
Financement(s) :
Allocation du ministère et monitorat |
Résumé :
Ce sujet de thèse se situe dans le domaine de l'analyse de données cérébrales acquises par imagerie par résonance magnétique dans le cadre de protocoles d'études de neurosciences. L'objectif de ces protocoles d'études est, dans le sens le plus large, la compréhension du fonctionnement du cerveau et de la relation entre anatomie et fonctions. Ces protocoles génèrent un grand nombre d'images dites "fonctionnelles" puisqu'elles contiennent une mesure de l'activité cérébrale en chaque point. Si un grand nombre de méthodes ont été présentées dans la littérature, l'analyse automatique de ces données est encore un problème ouvert. En particulier, l'énorme majorité des méthodes existantes considèrent ces données de manière volumique, c'est-à-dire définies dans le domaine tri-dimensionnel d'acquisition. Pourtant, l'essentiel de l'activité cérébrale a lieu dans le cortex, qui à notre échelle d'observation peut être considéré comme une surface. Il est maintenant avéré dans la littérature que ne considérer les données qu'au voisinage de la surface corticale, et projetées sur cette surface, présente beaucoup d'avantages : d'une part la géométrie de cette surface peut être prise en compte dans toutes les étapes de traitement, d'autre part la prise en compte de l'ensemble du volume réduit le pouvoir de détection des tests statistiques généralement employés. L'objectif de cette thèse est donc l'extension du champ d'application des méthodes volumiques vers le domaine surfacique.
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PUBLICATIONS
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@article {OBAC07,
audience = {internationale},
author = {G. Operto and R. Bulot and J-L. Anton and O. Coulon},
title = {Projection of fMRI data onto the cortical surface using anatomically-informed convolution kernels},
journal = {Neuroimage},
number = {39},
pages = {127--135},
year = {2008},
equipe = {I&M}
}
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@conference {KLNOCMF07,
author = {P. Kochunov and J. Lancaster and S. Narayana and G. Operto and O. Coulon and J-F. Mangin and P. Fox},
title = {Relationship between regional FDG uptake and other markers of cerebral health in normal aging},
booktitle = {13th Human Brain Mapping Conference},
year = {2007},
equipe = {I&M}
}
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@inproceedings {opertoMiccai06,
audience = {internationale},
author = {Operto G. and Bulot R. and Anton J-L. and Coulon O.},
title = {Anatomically informed convolution kernels for the projection of fMRI data on the cortical surface},
booktitle = {LNCS - Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2006: 9th International Conference},
editor = {R. Larsen and M. Nielsen and J. Sporring},
volume = {4191},
pages = {300--307},
publisher = {Springer-Verlag},
month = {octobre},
year = {2006},
equipe = {I&M}
}
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@inproceedings {GJKARO06,
audience = {internationale},
author = {Operto G. and Clouchoux C. and Anton J-L. and Dauchot K. and Sirigu A. and Bulot R. and Coulon O.},
title = {Cortical localization by surface parameterization : a gyrus-based approach},
booktitle = {12th Human Brain Mapping Conference},
month = {juin},
year = {2006},
equipe = {I&M}
}
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@inproceedings {coulon06,
audience = {internationale},
author = {Coulon O. and Clouchoux C. and Operto G. and Dauchot K. and Sirigu A. and Anton J.-L.},
title = {Cortical localization by surface parameterization : a sulcus-based approach},
booktitle = {12th Human Brain Mapping Conference},
month = {juin},
year = {2006},
equipe = {I&M}
}
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@inproceedings {clouchoux06,
audience = {internationale},
author = {Clouchoux C. and Coulon O. and Operto G. and Riviere D. and Dauchot K. and Sirigu A. and Anton J-L. and Regis J.},
title = {Cortical localization via hemisphere surface parameterization},
booktitle = {12th Human Brain Mapping Conference},
month = {juin},
year = {2006},
equipe = {I&M}
}
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@inproceedings {HJWODV06,
audience = {internationale},
author = {P. Havrankova and R. Jech and N. Walker and G. Operto and P. Dušek and J. Vymazal},
title = {Cortical involvement in active and passive motions in graphospasm},
booktitle = {12th Human Brain Mapping Conference},
month = {juin},
year = {2006},
equipe = {I&M}
}
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@techreport {OpertoM2Rech06,
author = {G. Operto and O. Coulon and C. Clouchoux and A. Cachia and J.-L. Anton},
title = {Param\'{e}trisation de la surface corticale \`{a} partir d'une parcellisation en gyri},
institution = {LSIS},
number = {LSIS.RR.2006.002},
month = {janvier},
year = {2006},
equipe = {I&M}
}
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@inproceedings {HJWODV05,
audience = {internationale},
author = {P. Havrankova and R. Jech and N. Walker and G. Operto and P. Dušek and J. Vymazal},
title = {Active and passive motion in patients with graphospasm: an event-related fMRI study},
booktitle = {16th International congress of Parkinson's disease and related disorders},
pages = {223},
year = {2005},
equipe = {I&M}
}
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@inproceedings {JONWORVR04,
audience = {internationale},
author = {R. Jech and L. Nov\'{a}kov\'{a} and N. Walker and G. Operto and J. Roth and J. Vymazal and E. Ružicka},
title = {Postanoxick\'{y} Myoklonus v Obraze Event-Related fMRI - Kazuistika},
booktitle = {19th Czech and Slovak Neurological Congress},
pages = {72--73},
year = {2004},
equipe = {I&M}
}
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operto
lsis
